El Tercer Batallón de Infantería comenzó a funcionar en el Centro de San Pedro Sula en el lugar que actualmente ocupa el edificio del Banco Atlántida, conocido en ese entonces como “Cuartel General”.

En el año de 1946 dicho cuartel se quemó ya que su estructura era de madera, posteriormente en el año 1949 se dio inicio a los trabajos de construcción en el lugar que hoy es la sede de la 105 Brigada de Infantería y el liceo militar del norte, siendo en ese entonces el comandante de la unidad el General Filiberto Díaz Zelaya y el Mayor de Plaza el Coronel Raúl Flores Gómez.

Dicho cuartel estaba compuesto por una compañía de fusileros y también se conoció como guarnición de san pedro sula, posteriormente nuestro territorio fue organizado en zona militar y el cuartel general paso a ser la segunda zona militar que tenía bajo su jurisdicción los departamentos de Cortés, Yoro, Atlántida, Islas de La Bahía y Trujillo y tenía sus oficinas en la parte de atrás donde hoy es el Banco Atlántida.